Bioinformaatika erikursus (YSX9030)
PÕHIANDMED
õppeaine register
A - põhiregister
õppeaine kood
YSX9030
õppeaine nimetus eesti k
Bioinformaatika erikursus
õppeaine nimetus inglise k
Special Course in Bioinformatics
õppeaine maht AP
2.00
õppeaine maht EAP
3.00
deklareeritav
jah
õppeaine täies mahus läbitav e-õppes
jah
kontrollivorm
eksam
õpetamise semester
sügis-kevad
õppekeel
eesti keel
inglise keel
Õppekavad, millesse aine kuulub
kavaversiooni kood
aine kohustuslik
LALD22/22
ei
Ainet õpetavad struktuuriüksused
LK - keemia ja biotehnoloogia instituut
Ainekaardi link
Tunniplaani link
Vaata tunniplaani
Versioon:
VERSIOONIPÕHISED ANDMED
õppeaine eesmärgid eesti k
Kursuse eesmärk on anda osalejatele vajalikud oskused ja teadmised R-i iseseisvaks kasutamiseks.
õppeaine eesmärgid inglise k
The aim of the course is to give the participants everything necessary to be able to independently work in R.
õppeaine õpiväljundid eesti k.
Õppeaine läbinud üliõpilane:
- töötab R-is ja RStudios;
- kirjutab funktsioone R-is;
- mõistab ggplot2 paketi graafika süntaksi kontseptsioone;
- mõistab andmete puhastamise kontseptsioone;
- filtreerib andmeid ja grupeerib neid paketi dplyr abil;
- raporteerib tulemusi RMarkdown/Quarto abil.
õppeaine õpiväljundid ingl k.
After completing the course the student:
- works in R and RStudio;
- writes functions in R;
- understands the concept of grammar of graphics and works with ggplot2;
- understands the concept of tidy data and converts data between long and wide format;
- filters data and summarizes it by groups with dplyr;
- has minimum necessary understanding of RMarkdown/Quarto.
õppeaine sisu lühikirjeldus eesti k
R on üks juhtivamaid ja võimsamaid andmeanalüüsi tööriistu, kuid selle õppimisega alustamine võib olla raske. Sissejuhatav kursus aitab üliõpilastel üle saada raskeimast, kattes kõik vajaliku, et R-iga tööd alustada. Kursusel läbitakse kaasaegne töövoog R-is kasutades pakette dplyr andmete puhastamiseks, tehakse graafikuid andmete esmaseks vaatluseks ja hilisemaks avaldamiseks ning antakse ülevaade Rmarkdown/Qarto võimalustest erinevat tüüpi failide kujundamisel ning analüüsi tulemuste raporteerimisel.
õppeaine sisu lühikirjeldus ingl k
R is one of the leading and most powerful tools for data analysis, but it is considered to have a rather steep initial learning curve. This introductory course helps you over the hardest part, covering everything necessary to get started with R. We will also go through the modern workflow in R using dplyr for data wrangling, grammar of graphics for both exploratory and publication-ready data visualization and give a basic overview of Rmarkdown/Quarto, which helps to integrate the statistical analysis in report-writing.
hindamisviis eesti k
Kursusetöö
hindamisviis ingl k
Course work
iseseisev töö eesti k
Moodle'is antud materjalide õppimine ja ülesannete täitmine.
iseseisev töö ingl k
Learning the materials handed out during the lecture.
õppekirjandus
Garrett Grolemund, Hadley Wickham. R for Data Science, O’Reilly.
õppevormid ja mahud
päevaõpe: nädalatunnid
2.0
sessioonõppe töömahud (semestris):
loenguid
0.0
loenguid
-
praktikume
1.0
praktikume
-
harjutusi
1.0
harjutusi
-
vastutav õppejõud
-
ÕPPEJÕU AINEKAVA INFO
õppetöö semester
õpetav õppejõud / üksus
õppetöö keel
Laiendatud ainekava või link Moodle või kodulehele
2023/2024 kevad
Agne Velthut-Meikas, LK - keemia ja biotehnoloogia instituut
inglise keel
    AINEKAVA_YSX9030_Agne V.M_.pdf 
    kuva rohkem
    2021/2022 kevad
    Olli-Pekka Smolander, LK - keemia ja biotehnoloogia instituut
    inglise keel
      2020/2021 kevad
      Olli-Pekka Smolander, LK - keemia ja biotehnoloogia instituut
      inglise keel
        2019/2020 kevad
        Olli-Pekka Smolander, LK - keemia ja biotehnoloogia instituut
        inglise keel, eesti keel
          2019/2020 sügis
          Agne Velthut-Meikas, LK - keemia ja biotehnoloogia instituut
          eesti keel
            2015/2016 sügis
            Anu Aaspõllu, LK - keemia ja biotehnoloogia instituut
            eesti keel
              2014/2015 kevad
              Anu Aaspõllu, LK - keemia ja biotehnoloogia instituut
              eesti keel
                2014/2015 sügis
                Anu Aaspõllu, LK - keemia ja biotehnoloogia instituut
                eesti keel
                  Ainekaart eesti keeles
                  Ainekaart inglise keeles