Aine eemsärk on anda süsteemne ülevaade biomolekulaarsete interaktsioonide teooriast ja uurimismeetoditest.

The aim of the course is to provide students with systematic overview of theories and methods in the field of biomolecular interactions.

Õppeaine läbinud üliõpilane:
- on omandanud ülevaatliku ettekujutuse biomolekulaarsetest interaktsioonidest ja hindab nende tähtsust;
- hindab kriitiliselt ja kasutab praktiliselt olulisemaid interaktsioonide uurimismeetodeid.

After completing this course the student:
- has acquired general knowledge about biomolecular interaction theories and evaluates their importance;
- critically evaluates and uses main methods of biomolecular interaction analysis.

Interaktoomika mõiste. Peamised biomolekulaarsete interaktsioonide tüübid: valk-valk, valk –lipiid, valk-polüsahhariid, valk-DNA, valk-membraan, valk-madalmolekulaarne ühend. Valk-valk interaktsioonide võrgustikud, nende analüüs. Interaktsioonipartnerite identifitseerimine: keemiline ristsidumine, kahe hübriidi süsteemid, kromatograafia, immuunosadestamine. Interaktsioonide visualiseerimine in vivo. Komplekside iseloomustamine ja uurimine: pinna plasmonite resonants, kalorimeetria, kromatograafia, elektroforees, ultracentrifuugimine, termoforees, tuumamagnetresonants, röntgen- struktuuranalüüs, fluorestsentsmeetodid, massispektromeetria. Interaktsioonide termodünaamika: afiinsus ja kineetika. Interaktoomika kasutamine ravimiarenduses

Interactomics as an independent discipline. Main types of biomolecular interactions: protein-protein, protein-lipid, protein-polysaccharide, protein-DNA, protein-membrane, protein-low molecular weight compound. Networks of protein–protein interactions, their analysis. Identification of interactions: chemical cross-linking, two-hybrid systems, chromatography, immunoprecipitation. Characterization and investigations of complexes: surface plasmon resonance, calorimetry, chromatography, electrophoresis, ultracentrifugation, microscale thermophoresis, nuclear magnetic resonance, fluorescence techniques, mass spectrometry. Visualization of interactions in vivo. Thermodynamics of biomolecular interactions: affinity and kinetics. Interactomics in drug development

Kirjalik eksam, mis sisaldab 10 teoreetilist küsimust ja viit ülesannet. Eksam loetakse sooritatuks, kui on saadud vähemalt 50% +1% võimalikest punktidest

Written examination that contains 15 theoretical questions + 5 problems. At least 50%+1 points of maxium points are needed to pass the examination

ülesannete lahendamine, harjutustundideks valmistumine

solving problems, preparation for seminars

soovituslikud
- E.A. Colemis, P.D.Adams. Protein-protein interactions. CSHL Press (2005)
- A. Panchenko, T.Przytycka. Protein-protein interactions and networks. Springer (2008)
- A. Cecilia, A Rogue. Ligand-macromolecular interactions. Springer (2008)

-